种子冷库用于存放各种粮食作物种子，适用于短期种子存放、中期种子保存以及战略种子库长期保存，在对种子进行品种改良、培育高产、抗逆性强的新品种研发中应用广泛。大部分种子冷库的温度在0℃~10℃左右，不同种子对冷库温度要求不同，可按需求定制。

短期种子冷库：生产性种子，冷库相对温度在15℃~20℃，相对湿度50%~60%，保存种子寿命在1~5年。

中期种子冷库：流动性种子，冷库相对温度在0℃~10℃，相对湿度不大于60%，保存种子寿命在10~30年。

长期战略种子冷库：长时间保存种子，冷库相对温度在-10℃~-20℃，相对湿度不大于60%，保存种子寿命在30~50年。

种子冷库也可以根据气调库标准进行修建，根据不同种子的需求进行气调储藏，可以更有效地提高种子保存质量和时效。

种子冷库的建设及使用注意事项，除了参考标准冷库、气调库的建设、使用要求外，要额外注意库区的防水、消防、防晒及自然灾害对库体产生冲击导致种子腐烂或变质，失去活力，导致生产力严重下降。